La UNMdP tiene un histórico lazo de trabajo en conjunto con el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET)

Mas de 900 científicos y técnicos del CONICET trabajan en las diferentes Unidades Académicas de la UNMdP, de los cuales cerca de 500 son además docentes de la casa. La multiplicidad de disciplinas desarrolladas se integra en 8 Institutos de Investigación de dependencia compartida entra la UNMdP y el CONICET.

Desde el año 2007, la cooperación entre ambas instituciones se ha formalizado a través de un convenio interinstitucional.